Das Schweizerische Tropeninstitut (STI) wurde 1943 gegründet. Von Anfang an verband das Institut Forschung, Ausbildung und medizinische Dienstleistungen. Im Mittelpunkt stand die Erforschung der Übertragung von Malaria, Afrikanischer Schlafkrankheit und Rückfallfieber durch Parasiten, Mücken, Fliegen und Zecken. Die Entwicklung des Instituts wurde massgeblich von seinem Gründungsdirektor Rudolf Geigy geprägt. In den 1950er Jahren gründete das STI zwei Feldlabors in Afrika. Neben der Grundlagenforschung rückte vermehrt die Entwicklungszusammenarbeit in den Fokus. Insbesondere Tansania wurde zu einem Schwerpunktland der schweizerischen Entwicklungszusammenarbeit.

Seit Beginn der Neunzigerjahre erlebte das STI ein enormes Wachstum. Ab Mitte des Jahrzehnts weitete es seine Dienstleistungen auf Osteuropa und Zentralasien aus. Nachdem 2009 das Institut für Sozial- und Präventivmedizin (ISPM) der Universität Basel integriert worden war, erfolgte die Umbenennung des STI in Schweizerisches Tropen- und Public Health-Institut (Swiss TPH). 2022 verliess das Swiss TPH seinen alten Standort an der Socinstrasse in Basel und bezog in Allschwil den neuen Hauptsitz «Belo Horizonte».

Der Jahresbericht des Instituts erschien erstmals 1944. Er enthält Berichte zu den Tätigkeiten in den Departementen, zu Forschung und Lehre sowie zu Mitarbeitern und Finanzen.